GEN2PHEN – P3G MoU Press Release

Embedded Scribd iPaper - Requires Javascript and Flash Player
  FOR IMMEDIATE RELEASE    Two International Scientific Projects Based in Europe and Canada Synergize Research to  Address Connections between Genetics and Diseases   
 
International  science  consortia  GEN2PHEN  and  the  Public  Population  Project  in  Genomics  (P3G)  have  signed  an  agreement to coordinate the participation of 45 genetics‐based research institutions from 25 countries.  European‐ based  GEN2PHEN  and  Montreal‐based  international  consortium  P3G  will  be  working  together  to  harmonize  the  electronic  gathering  and  use  of  data  showing  how  gene  sequences  contribute  to  inter‐individual  differences  in  diseases, drug responses, and other characteristics.   Many  major  gene  mutations  are  known  to  cause  “rare”  hereditary  disorders  and  the  role  of  numerous  normal  genetic  variations  in  contributing  risk  of  “common”  disorders  is  steadily  becoming  clear.  Such  research  is  proceeding at an ever faster pace due to rapid advances in various technologies. Consequently, an unprecedented  torrent  of  critically  important  data  and  analysis  is  becoming  available.  Presently,  there  is  a  need  for  a  universal  system capable of processing the deluge of data to make it easily accessible to researchers and doctors committed  to  identifying  treatments  and  cures,  while  balancing  the  importance  of  maintaining  the  integrity  of  data  and  samples, as well as legal, ethical and social issues.  The  agreement  between  P3G  and  GEN2PHEN  is  intended  to  provide  the  general  framework  for  collaboration  between the Partners on areas of common interest, such as;  • • • • • • development  and  dissemination  of  standards  for  storage  and  use  and  management  of  genotype‐ phenotype information  development and role of tools to identify researchers automatically when accessing online databases  tools and infrastructures for genotype‐phenotype data sharing and utilisation  joint approaches to data‐basing and data analysis  systems  to  foster  scientific  activities  outside  academia;  such  as  the  generation  and  release  of  data,  resource development, contributions to web 2.0 knowledge environments  social, legal, and ethical dimensions of the above areas of common interest 
 
The two projects will be engaged in identifying potential synergies and initiatives, ways to promote joint scientific,  educational  and  dissemination  activities,  and  resource  sharing.  In  this  way,  GEN2PHEN  and  P3G  will  assist  each  other  in  performing  their  respective  activities  in  a  more  effective  manner  with  the  intention  of  benefitting  the  international scientific community and others.   
 
1
  More about P3G 
P
The  Public  Population  Project  in  Genomics  (P³G)  is  a  not‐for‐profit  international  consortium  dedicated  to  fostering  collaboration  between  population  genomics  researchers.  P3G  achieves  this  mission  through  the  development  of  free  and  accessible research tools, resources and methods that help optimize and harmonize the design of biobank infrastructures and  research projects.  P³G has built a global network of biobanks and experts representing the broad range of knowledge required  to develop this field. Working with this community of experts, P³G strives to optimize the design of biobanks and facilitate the  harmonization of research materials, methods and studies by developing innovative approaches and tools capable of meeting  the  challenges  of  complex,  cutting‐edge  genomic,  epidemiological  and  environmental  research.  Understanding  that  sharing  information leads to scientific progress, P³G makes this knowledge freely available to the international scientific community  through the P³G Observatory website. With membership from over 40 countries – and growing – P³G benefits from a critical  mass of experts and biobank leaders dedicated to shaping and improving all aspects in the field of population genomics. P3G is  chaired  by  Professor  Bartha  Maria  Knoppers.  Dr.  Paul  Burton  is  P3G’s  Chief  Scientific  Officer  and  Isabel  Fortier  is  Research  Director. P3G is funded by Genome Canada and Genome Québec. 
P P P P
For more information about P3G, please visit www.p3g.org or email secretariat@p3g.org 
P
More about GEN2PHEN   The GEN2PHEN Consortium aims to unify human and model organism genetic variation databases towards increasingly holistic  views into Genotype‐to‐Phenotype (G2P) data, and to link this system into other biomedical knowledge sources via genome  browser  functionality.  The  project  is  coordinated  by  Professor  Anthony  J.  Brookes  from  the  University  of  Leicester,  and  performed by a consortium of 20 leading scientific institutions. The project benefits from a 12 million Euro grant awarded by  the European Commission under by the 7th Framework Programme for Research and Technological Development.   GEN2PHEN aims to establish the technological building‐blocks needed for the evolution of today’s diverse G2P databases into  a  future  seamless  G2P  biomedical  knowledge  environment.  The  project  will  then  utilise  these  elements  to  construct  an  operational  first‐version  of  that  knowledge  environment.  GEN2PHEN  activities  will  significantly  improve  the  database  infrastructure available within Europe for the collation, storage, and analysis of human and model‐organism G2P data. This will  be  achieved  by  developing  various  cutting‐edge  solutions  and  deploying  them  in  conjunction  with  proven  concepts,  in  a  manner  that  will  transform  the  current  elementary  G2P  database  reality  into  a  powerfully  networked  hierarchy  of  bioinformatics  GRID‐linked  databases,  tools  and  standards.  As  part  of  this,  GEN2PHEN  has  launched  a  major  genotype‐ phenotype internet portal (the GEN2PHEN Knowledge Centre) to provide a ‘virtual centre of excellence’ for G2P field that will  provide  general  information  on  field  developments,  specific  information  on  the  GEN2PHEN  project,  and  full  and  immediate  access to all the project deliverables/outputs that the G2P community might wish to access.   For more information about GEN2PHEN please visit www.gen2phen.org or contact:  Professor Anthony J. Brookes (Project Co‐ordinator): eml: ajb97@le.ac.uk   Mr. Carlos Díaz (Project Manager): eml: cmdiaz@imim.es   Ms. Eva Molero (Press and Media): eml: emolero@imim.es     NOTES TO EDITORS:  List of participating institutions:  GEN2PHEN 
• • • • • • • • • • University of Leicester (UK)  EMBL‐European Bioinformatics Institute (UK)  Fundació IMIM (Spain)  Leiden University Medical Center (Netherlands)  Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale,  (France)  Karolinska Institute (Sweden)  Foundation for Research and Technology – Hellas (Greece)  Commissariat à l’Energie Atomique (France)  Erasmus University Medical Center (Netherlands)  Institute for Molecular Medicine Finland, University of Helsinki  • • • • • • • • • •
P3G Charter Members 
Avon Longitudinal Study of Parents and Children (UK)  Biobank Popgen (Germany)  CARTaGENE (Canada)  Centre for Integrated Genomic Medical Research Manchester,  (UK)  Danubian Biobank Foundation (Central Europe)  Estonian Genome Project of University of Tartu (Estonia)  Generation Scotland (UK)  GenomeEUtwin (Helsinki)  INMEGEN (Mexico)  INSERM (France)  2
• • • • • • • • • •
(Finland)  University of Aveiro – IEETA (Portugal)  University of Western Cape (South Africa)  Council of Scientific and Industrial Research. Inst. of Genomics  and Integrative Biology (India)  Swiss Institute of Bioinformatics (Switzerland)  University of Manchester (UK)  BioBase GmbH (Germany)  deCODE genetics ehf (Iceland)  PhenoSystems SA (Belgium)  Biocomputing Platforms Ltd Oy (Finland)  University of Patras (Greece) 
• • • • • • • • • • • • • • • •
Institute of Genomics and Integrative Biology (India)  King  Abdullah  International  Medical  Research  Center  (Saudi  Arabia)  KORA‐Gen (Germany)  LifeGene, (Sweden)  LifeLines Cohort (Netherlands)  National Cancer Institute (NIH) (USA)  National DNA Bank (Spain)  National Heart, Lung and Blood Institute (NIH) (USA)  Norwegian Institute of Public Health (Norway)  NUgene (USA)  Ontario Cancer Consortium (Canada)  Singapore Tissue Network (Singapore)  String of Pearls Initiative (Netherlands)  Taiwan  Biobank  Institute  of  Biomedical  Sciences,  Academia  Sinica (Taiwan)  UK Biobank (UK)  Western Australia Genome Health Project (Australia) 
3